Флористическое и фаунистическое богатство озера, а также другие
аспекты биоразнообра- зия Ладожского озера связаны со следующими тремя основными
группами причин:
Геологическими особенностями водоема;
Географическим положением;
Генезисом флоры и фауны в послеледниковый период.
Лимногенез (т.е. озерная сукцессия) тесно связан с перечисленным выше, однако может рассматриваться и как одна из основных самостоятельных причин, влияющих на биологическое разнообразие водоема.
В новейшей истории Ладожского озера происходили неоднократные
изменения уровня, сопровождавшиеся значительными изменениями площади и
конфигурации озерной котловины. Формирование современной морфоструктуры озерной
котловины завершилось в раннем - среднем плейстоцене. Ведущую роль в
становлении современного рельефа дна и побережья озера сыграло последнее
валдайское оледенение. Потепление климата приблизительно 10 тысяч лет назад
привело к уменьшению мощности ледникового покрова в Фенноскандии. Последовавшее
изостатическое поднятие территории вызвало быструю регрессию, и Ладожское озеро
впервые стало самостоятельным бассейном со стоком через северную часть
Карельского перешейка. Очередное повышение уровня озера около 2 000 л. назад
привело к образованию реки Невы.
Геологические особенности (происхождение) водоема
выявляются как через состав материнских пород, так и через неоднородность
морфометрии котловины. Формирование котловины озера происходило на стыке
Балтийского кристаллического щита и Русской платформы, она приурочена к
грабену - геологической структуре, которая представляет собой крупный блок
земной коры, опущенный по разломам относительно обрамления (Ильин, 1978). С этим связаны и значительные размеры озера, и геоморфологическая неоднородность его частей. Три его района поэтому различаются по целому ряду параметров (см. ниже), в том числе по составу донных осадков и химизму воды.